蚊叔（曾江 饰）是位职业的杀手代理人，其亲生儿子K.K（谭耀文 饰）和养子金鹰（张学友 饰）都是其手下得力的杀手。在一次行动中，二人结识了Joy（王祖贤 饰），在慢慢的相处中金鹰和Joy顺其自然的相恋了。金鹰此时却接到了一个任务：替Joy父亲的死对头大碌杀掉Joy父亲。后任务由KK执行，却未能成功，更意外的是，大碌中了KK的飞刀而死。这让杀手集团误以为是KK等人设计干掉了集团的客人大碌，遵照集团的规矩，KK等人必须被处死，而且集团的霍老已经将金鹰、KK、Joy抓了起来，并要求蚊叔亲手处决。一边是亲人的性命，一面是难以抵抗的暴力，蚊叔该如何抉择？他们能够逃过此劫吗？

大明宣宗年间，江浙富庶小镇获鹿镇近来连出怪事：百年难遇的大水冲毁镇外石桥；赵阁老孙媳大婚当夜无故失踪；河上惊现无名女尸，镇上谣言四起，人心惶惶。朝廷将这一系列棘手案子交由北镇抚司小旗秦吾卫着手侦破。 秦吾卫在与当地捕头胡松，神秘女子任童童一同查案期间，针对女人的凶案竟依旧频频发生，秦吾卫越深挖案情越觉这一系列罪案，内情吊诡凶险。层层迷雾笼罩之下，真凶何在？造下此般罪孽又意欲何为……

友为人憨直，虽服务警队十年，有劳但无功。结婚七年，其妻在商界春风得意，与友生活习惯及思想行为距离愈来愈远，其妻卒不辞而别。友在查案中得知消息，大失常态，险些累及女警吴君如身陷险境，二人自此积怨……

六年前，梁森（梁家辉 饰）告别心伤爱人梅伊（梅艳芳 饰），来到后方参加地下党，梅则按照吴先生（曾江 饰）的安排成为夜总会歌女。　　1941年，太平洋战争爆发，世界局势动荡不安。梁森和革命同志重返上海公共租界，当晚便目睹五个日本和尚惨遭杀害的景象，而幕后指使者竟是日本人白川（国村隼 饰）。梁尾随白川来至夜总会，两人发生搏斗，白川被杀，梁也多处负伤。养伤之际，梁森重逢爱人梅伊，旧情不断，难以割舍。　　白川之死激化租界内的矛盾，76局特务头子铁泽民（徐少强 饰）对地下党进行无情捕杀……

杀手亚庄（周润发）在一次暗杀行动中误伤了歌星Jennie（叶倩文），令其双目接近失明，自此，深感内疚的他开始暗中保护、帮助 Jennie，并想趁她眼睛完全失明前筹一笔款送她去国外医治，为此，亚庄铤而走险再当杀手，不想任务完成后不但没收到钱，反被雇他杀人的汪海派人追杀。　　奉命侦查相关命案的警探李鹰（李修贤）在查案过程中知晓事情另有隐情，亚庄并非冷血杀手，开始同其惺惺相惜，而在应对汪海势力的追杀中，两人更是结成生死之交。然而亚庄的命运，似乎是被注定了。

香港某个国际伪钞集团重要分子宋子豪（狄龙 饰）和Mark（周润发 饰）情同手足，某次宋子豪带手下谭成（李子雄 饰）去台北交易时被其出卖受枪伤被捕入狱，为替好兄弟报仇，Mark孤身赴台，结果被人打成瘸子，江湖地位自此一落千丈，而宋子豪的父亲也在不久丧命。 一向视宋子豪为偶像的宋子杰（张国荣 饰）得知哥哥的真实身份后，对黑社会及他恨之入骨，立誓利用警察身份将黑帮势力斩草除根，宋子豪出狱后不顾苦等他想重创辉煌的Mark的劝阻，决心弃暗投明，无奈得不到宋子杰的谅解。而此时已成帮会老大的谭成欲找宋子豪再合作，遭拒绝后放言会害宋子杰，被逼走投无路，宋子豪决定再与Mark连手共抗强敌。

第一部中，小马哥（周润发 饰）死在乱枪之下，宋子豪（狄龙 饰）和弟弟宋子杰（张国荣 饰）冰释前嫌，英雄的故事还在继续。　　警方怀疑宋子豪的恩师龙四（石天 饰）利用船厂做掩护，暗中操纵伪钞集团，派宋子杰去接近龙四的女儿小辉，做卧底，宋子豪为了弟弟的安全，不得不假释出狱，协助警方调查。　　其实，龙四对手下的犯罪行为并不知情，他被亲信高英培陷害，不得不逃亡纽约，女儿的被害，使他精神失常，在小马哥弟弟阿健（周润发 饰）的帮助和保护下，才渐渐恢复神智。出于道义，阿健放弃了经营多年的餐厅，同龙四共同返港。　　香港这边，宋氏兄弟几近艰险终于获得了高英培的信任，掌握了伪钞集团的犯罪证据，和阿健、龙四会和后，四人策划了火爆的复仇行动，也付出了鲜血甚至性命的代价。

曾健乃香港贩毒头子，因被小红，及Ida所率领的警队追捕而仓忙潜逃至泰国，留下情妇Carry在香港。数年后曾健以泰国华侨沙华的身份返港，而Carry已下嫁警司金志远，曾知悉后非常愤怒，故设赌局欺骗志远，令志远欠下巨债，被迫替曾卖命，与此同时Ida四出调查曾健，令曾的交易受阻，曾设计杀死志远及嫁祸Ida。

杨氏家族是香港首屈一指的黑帮大家族，家长杨云峰深受黑白两道敬重，长子杨鐡岳，女儿杨小青俱才智过人，养子阿龙长袖善舞，智囊Micheal则深藏不露，在一次杨家与三大家族恶斗中，云峰，鐡岳与及男友Peter均遭伏击惨死，父死兄，亲夫亦亡，小青坚强无比，决定复仇，以暴易暴，而Micheal亦对小青产生爱意决定助小青查出 幕后主谋人……

民国年间，草药世家大公子白乾枫（钱泳辰 饰）几年前外出遇难，家中留下尚未拜堂的采薇（娄艺潇 饰）。采薇温柔贤惠，不谙豪门是非，被大少奶奶马馥芳（宣萱 饰）陷害，被迫转嫁二少爷乾笙（韩栋 饰）。乾笙羸弱平和，对采薇关爱有加，这引起马馥芳和妾室秋琳（仝晓燕 饰）百般刁难。马馥芳嫁到白家多年，从未生下一男半女，在家族中颇遭微词，与妯娌间多有矛盾。善良的采薇不愿在勾心斗角中生存，她积极化解矛盾，以求和睦相处，并逐渐在生活中与乾笙产生感情。就在这时，原以为葬身他乡的乾枫突然返回，家中引起不小震动。马馥芳趁机作祟，使采薇陷入尴尬境地。没过多久，白家命运发生了惊天逆转......